近日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心代海强研究组与吴薇研究组,基于高通量全基因组易位测序技术,开发出新型DNA测序方法HTGTS-TCR-seq,旨在精准解析αβ T细胞受体(TCR)重排过程。
传统TCR检测方法主要依赖多重PCR和5'RACE等技术,但mRNA水平的5'cDNA末端快速扩增技术受转录本丰度影响,无法反映DNA水平的初始重排情况。同时,DNA水平的多重PCR需大量特异性引物,始终存在引物偏倚。
研究基于线性扩增介导的PCR技术,通过对TCR基因片段进行有限数量的引物设计,靶向TCR基因片段,从而直接捕获基因组重排事件。该方法从源头上规避了引物偏倚,在DNA层面实现对重组效率、功能性与非功能性TCR重排的检测分析。
研究进一步利用该体系,对小鼠胸腺细胞不同发育阶段进行分析。结果显示:DN3发育阶段非功能性重组频率较高,阳性选择前的双阳性胸腺细胞功能性重组频率较高,与理论预期高度吻合;双阳性胸腺细胞在Tcra重排上呈现出阶梯式重排特征,印证了连续发生的初级与次级重排事件模型。
在年龄相关研究中,团队发现衰老改变Vα片段的使用偏好。这一趋势在胸腺非成熟T细胞和外周成熟T细胞中均一致,提示小鼠中这一增龄性改变源于胸腺输出环节。为将方法应用推广至机制研究,团队剖析Wapl基因敲除的阳性选择前的双阳性胸腺细胞发现,黏连蛋白卸载因子WAPL独立于细胞分裂的作用,进而影响Tcra基因重排。同时,团队通过对人源特异性引物设计,将应用推广至人类外周T细胞样品。
这一研究建立了新型无偏倚的基因组TCR测序方法,揭示了发育阶段特异性V/J片段使用规律及增龄性TCR变化,证实该方法在人类样本中具有同等应用潜力,为T细胞发育、衰老和免疫相关疾病等研究提供了新视角。
10月27日,相关研究成果在线发表在《先进科学》(Advanced Science)上。研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金、中国科学院战略性先导科技专项、中国科学院国际伙伴计划等的支持。
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HTGTS-TCR-seq技术示意图
11月10日,记者从中国地质大学(武汉)获悉,由该校牵头,武汉大学、中国科学院精密测量科学与技术创新研究院、中国科学院武汉岩 新时代迈向中国式现代化的学前教育高质量发展离不开有力的法治保障。近日,《中华人民共和国学前教育法》(下称《学前教育法》)颁布。《学前教育法》设专章对幼儿园如何开展保育教育工作予以规范 近年来,学前教育得到快速发展,但仍是国民教育体系的薄弱环节,需要通过立法,贯彻落实党中央、国务院决策部署,破解突出问题,为学前教育高质量发展提供法治保障。在此背景下,《中华人民共和国学前教育 学龄前时期是儿童身心发展的重要阶段,学前教育是国民教育体系的重要组成部分。习近平总书记强调:“要加强对基础教育的支持力度,办好学前教育。”为实现“幼有所育”,规范和促进学前教育发展,满足 “欢迎小主人回家。天黑了,已经为你打开客厅灯光和空调,电视正在播放你喜欢的新闻联播……”“老师快看!‘小飞’和我互动了!”在天津益中学校的人工智能实验室里,学生们在老师的指导下操控平板电 教育部关于做好2025届全国普通高校毕业生就业创业工作的通知教就业〔2024〕5号各省、自治区、直辖市教育厅(教委),新疆生产建设兵团教育局,有关省、自治区人力资源社会保障厅,部属各高等学校、部 。本文链接:研究开发出无偏倚基因组TCR测序新技术http://www.sushuapos.com/show-12-2005-0.html
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