肿瘤组织具有高度异质性,这导致传统的空间转录组技术难以全面揭示其特性。2月20日,记者从西安交通大学获悉,为了解决这一难题,该校教授叶凯及其团队提出了STMiner方法,即利用基因表达的空间分布来构建肿瘤组织的整体计算框架,相关研究成果于近日发表在《细胞·基因组学》杂志上。
叶凯表示,传统方法通常将肿瘤组织的采样点视为独立的“房子”,统计每个采样点的细胞类型和基因表达信息。然而肿瘤组织细胞类型多样、基因表达杂乱无章、区域界限模糊,传统办法很容易产生误差。STMiner方法能利用二维高斯混合模型和最优传输理论,将离散的采样点转化为连续的基因分布地图,就像把零散的房屋信息绘制成一张完整的居民分布图。这不仅能更准确地反映肿瘤组织的真实情况,还能减少干扰信息,帮助科学家更清晰地观察基因的空间分布规律。
凭借这一方法,叶凯教授团队成功定位了高度复杂、边界不清的肿瘤组织中的独特基因表达模式,清晰区分了正常与异常组织的边界,并识别出一些此前被忽视的关键基因和空间结构。
肿瘤组织具有高度异质性,这导致传统的空间转录组技术难以全面揭示其特性。2月20日,记者从西安交通大学获悉,为了解决这一难题,该校教授叶凯及其团队提出了STMiner方法,即利用基因表达的空间分布来构建肿瘤组织的整体计算框架,相关研究成果于近日发表在《细胞·基因组学》杂志上。
叶凯表示,传统方法通常将肿瘤组织的采样点视为独立的“房子”,统计每个采样点的细胞类型和基因表达信息。然而肿瘤组织细胞类型多样、基因表达杂乱无章、区域界限模糊,传统办法很容易产生误差。STMiner方法能利用二维高斯混合模型和最优传输理论,将离散的采样点转化为连续的基因分布地图,就像把零散的房屋信息绘制成一张完整的居民分布图。这不仅能更准确地反映肿瘤组织的真实情况,还能减少干扰信息,帮助科学家更清晰地观察基因的空间分布规律。
凭借这一方法,叶凯教授团队成功定位了高度复杂、边界不清的肿瘤组织中的独特基因表达模式,清晰区分了正常与异常组织的边界,并识别出一些此前被忽视的关键基因和空间结构。
美国《新闻周刊》网站2月4日刊登题为《人工智能可能会在数十年内解开人体的秘密》的文章,作者是亚历克斯·菲利普斯,内容编译如下:一位医生(同时也是一本关于新兴技术在医疗领域应用的新 3月21日是世界睡眠日,今年中国主题为“健康睡眠 人人共享”。人的一生约有三分之一的时间是在睡眠中度过,睡眠、运动、营养被视为保障机体正常发育和健康的三大要素。关于睡眠有哪些常见认知误 科技日报从哈尔滨工业大学获悉,北京时间2024年3月20日8时31分28秒,“天都一号”“天都二号”通导技术试验星伴随探月工程四期鹊桥二号中继星任务搭乘长征八号遥三运载火箭从文昌航天发射场发射 21世纪经济报道记者王峰北京报道 近日,全球教育集团培生(NYSE:PSO)公布2023财年财报。2023财年,培生的销售额为36.74亿英镑(下同),同比下降4%,但基础销售额同比增长1%;调整后营业利润5.73亿,同 3月22日消息,xiaomi集团的许斐在微博上表示,xiaomiCivi 4 Pro的预售业绩远超预期,尤其是春野绿配色,许多门店都出现了缺货情况。据了解,xiaomiCivi 4 Pro的春野绿后盖左侧采用了全新的绮彩鎏光工艺,通 俄罗斯国家航天集团23日发布消息说,俄当天成功发射了“联盟MS-25”载人飞船。消息说,莫斯科时间23日15时36分(北京时间20时36分),“联盟MS-25”载人飞船搭乘“联盟-2.1a”运载火箭从哈萨克斯坦境 。本文链接:新方法准确反映肿瘤组织真实情况http://www.sushuapos.com/show-2-10828-0.html
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