3月19日,记者从中国科学院海洋研究所了解到,该所研究团队在国际上首次发布了银鲳的高质量染色体水平参考基因组。相关研究论文近日在线发表于《自然》子刊《科学数据》。
银鲳广泛分布于西北太平洋近岸海域,肉质细腻,油脂丰富,是我国重要的经济鱼类。近年来,由于过度捕捞,野生银鲳资源急剧衰退。我国银鲳人工繁育与养殖技术虽取得突破性进展,但银鲳对环境变化极为敏感,在运输和养殖过程中容易发生应激死亡,这大大制约了银鲳养殖产业的发展。
在前期研究的基础上,中国科学院海洋研究所刘静研究团队综合采用二代、三代高通量测序技术以及染色体构象捕获技术,对银鲳基因组进行了深度测序和组装,在国际上首次获得了银鲳的高质量染色体水平参考基因组,得到银鲳24条染色体单体序列。研究精确揭示了银鲳基因组大小为5.1806亿个碱基,指示基因完整度的两个指标——Contig N50和Scaffold N50长度均达两千万碱基级别,这表明该基因组完整度极高,达到染色体级别。最终,研究人员获得了24696个蛋白编码基因,通用单拷贝直系同源基因基准数据集的评估值高达98.90%。
该研究成果为深入解析银鲳食道侧囊和腹鳍缺失性状演化、种质遗传资源评估、抗逆品种选育及银鲳渔业资源可持续利用等研究提供了高质量参考基因组基础。
3月19日,记者从中国科学院海洋研究所了解到,该所研究团队在国际上首次发布了银鲳的高质量染色体水平参考基因组。相关研究论文近日在线发表于《自然》子刊《科学数据》。
银鲳广泛分布于西北太平洋近岸海域,肉质细腻,油脂丰富,是我国重要的经济鱼类。近年来,由于过度捕捞,野生银鲳资源急剧衰退。我国银鲳人工繁育与养殖技术虽取得突破性进展,但银鲳对环境变化极为敏感,在运输和养殖过程中容易发生应激死亡,这大大制约了银鲳养殖产业的发展。
在前期研究的基础上,中国科学院海洋研究所刘静研究团队综合采用二代、三代高通量测序技术以及染色体构象捕获技术,对银鲳基因组进行了深度测序和组装,在国际上首次获得了银鲳的高质量染色体水平参考基因组,得到银鲳24条染色体单体序列。研究精确揭示了银鲳基因组大小为5.1806亿个碱基,指示基因完整度的两个指标——Contig N50和Scaffold N50长度均达两千万碱基级别,这表明该基因组完整度极高,达到染色体级别。最终,研究人员获得了24696个蛋白编码基因,通用单拷贝直系同源基因基准数据集的评估值高达98.90%。
该研究成果为深入解析银鲳食道侧囊和腹鳍缺失性状演化、种质遗传资源评估、抗逆品种选育及银鲳渔业资源可持续利用等研究提供了高质量参考基因组基础。
国际天文学家团队绘制了迄今最大的三维宇宙地图,记录了大约130万个活跃类星体在空间和时间上的位置。它将成为探测类星体、暗物质晕和超大质量黑洞的强大工具。发表在最新一期《天体物理学杂 据一项在本周举行的美国心脏协会会议上提交的新研究,每天进食时间控制在8小时内的间歇性禁食方法可能与心脏病死亡风险上升相关。近年来越来越流行的间歇性禁食指限制进食时间,在每天或每周的 3月23日消息,vivo即将于3月26日发布vivo X Fold3系列折叠屏电话,其中包含vivo X Fold3和vivo X Fold3 Pro两款新品。据悉,vivo X Fold3采用了首发的碳纤维龙骨铰链,重量仅为219克,厚度为4.65毫米。相 3月25日消息,国内一场经济高峰论坛上,iPhone总裁蒂姆·库克再次成为焦点。然而,引起人们关注的并非库克的讲话内容,而是一张自拍照片。在论坛现场,一位观众与库克自拍合影,但引人注目的是她手中 全球首台无细胞蛋白质合成生物反应器、全球首台全高温超导托卡马克装置(洪荒70)、64比特超导量子计算机研发与产业化项目、深海可燃冰探采重载作业机器人系统研制、载人电动复合翼垂直起降飞行 “啪嗒啪嗒......”一只机器狗在街上迈着规律的步伐,拉着牵引绳的盲人,在它的带领下越过沿路障碍,平稳地行走着,电子导盲犬能否取代传统导盲犬,解决视障人士一犬难求的困境?西工大团队在这方面开展 。
本文链接:银鲳高质量染色体水平 参考基因组发布http://www.sushuapos.com/show-2-4079-0.html
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