发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)是一种蜱传高致病性布尼亚病毒,可引起高热、血小板减少及多器官功能衰竭。目前尚无针对该病毒的获批疫苗或特异性抗病毒药物。在病毒生命周期中,核衣壳蛋白(NP)通过结合并封装病毒基因组RNA,形成核糖核蛋白复合物(RNP),以保护病毒基因组,并参与病毒基因组的复制和转录。因此,阐明RNP的形成机制对理解病毒复制策略及抗病毒药物研发具有重要意义。
近日,中国科学院武汉病毒研究所研究团队,在SFTSV核糖核蛋白复合物形成机制研究中取得进展。
研究发现,重组表达的SFTSV NP可与RNA自组装,形成不同聚集状态的复合物。研究解析了其与单链RNA形成的五聚体复合物结构。五个NP亚基通过其N端结构域介导相互作用,组装成环状五聚体。RNA分子被固定在五聚体内部的沟槽中,所有碱基均朝向蛋白内部,呈封闭构象,表明RNA在封装状态下无法直接参与复制和转录。NP亚基含有1个保守的疏水性结合沟槽,可容纳四个核苷酸,并在亚基界面额外结合2至3个核苷酸,形成序列非依赖但高度稳定的结合模式。微复制子实验表明,突变NP上与RNA结合的关键氨基酸,可抑制报告基因表达,验证了复合物中鉴定的RNA结合氨基酸功能的重要性。
对同科154个病毒NP蛋白的保守性分析显示,其RNA结合沟槽高度保守,提示该科病毒NP或采用类似的RNA结合机制,并具有作为广谱抗病毒靶点的潜力。在冷冻电镜密度中,科研人员观察到一段未建模的密度,将RNA的5′端和3′端连接起来,这段密度很可能对应RNA的未建模末端区域。这些末端序列相互互补,或形成RNA双链结构。布尼亚病毒各基因组片段的5′端和3′端在同一病毒种内高度保守,并具有较强的互补性,或形成“锅柄”状的双链茎结构,使病毒基因组片段形成环状。
基于以上研究,团队提出SFTSV RNP组装模型。SFTSV RNP可通过RNA的“锅柄”结构及NP-NP相互作用形成环状构象,病毒RNA聚合酶通过识别该锅柄结构来启动RNA合成。在延伸过程中,靠近复制中心的NP暂时解离,使包裹的基因组RNA暴露出来,从而被RNA聚合酶识别。同时,NP通过其柔性的N-arm维持空间定位。当RNA聚合酶通过后,暂时脱离的基因组RNA会重新被NP包裹。
该研究揭示了SFTSV NP的RNA封装机制,为开发针对SFTSV及相关高致病性布尼亚病毒的广谱抗病毒药物提供了重要结构基础。
相关成果发表在mBio上。研究工作得到国家重点研发计划和国家自然科学基金等的支持。
SFTSV RNP示意图
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