中国科学院上海药物研究所研究员陈士羽团队，提出了一种全新的非天然多肽文库构建策略，通过固相捕获与纯化相结合的设计，有效突破了传统DNA编码多肽文库在质量控制和序列偏向方面的技术瓶颈，为多肽药物的高效筛选与开发提供了更稳健和可拓展的基础平台。2月18日，相关研究成果发表于美国《国家科学院院刊》。
近年来，多肽类药物在有效性与安全性方面的优势日益凸显，多种创新疗法陆续获批用于临床治疗。DNA编码多肽文库（PDEL）具有高通量、操作简便、样品需求量低、筛选成本可控及流程高效等特点，在非天然多肽分子的发现中展现出独特优势。然而，现有PDEL缺乏有效的纯化手段，在文库长度、整体纯度及序列均一性方面存在明显限制。
研究团队提出了一种基于叠氮修饰Fmoc（mFmoc）保护氨基酸的PDEL构建策略，可实现叠氮功能化氨基酸在建库时与炔基修饰介孔硅胶固相载体之间的高效共价偶联；随后在常规5%哌啶Fmoc脱保护条件下，同步完成多肽释放与固相纯化，从而获得高纯度DNA编码多肽文库。通过在每一轮合成后进行固相纯化，研究团队成功构建了一个由5残基组成、整体纯度超过95%的DNA编码多肽文库，显著提升了文库质量与序列可靠性。
研究团队以转铁蛋白受体1（TfR1）为筛选靶点，分别采用纯化PDEL与传统DNA编码D型多肽文库开展平行筛选并进行系统比较。结果显示，基于纯化策略构建的文库所获得的候选多肽在序列同源性与靶点特异性方面均显著提升，充分体现了该方法在提高筛选准确性与效率方面的优势。进一步地，研究团队对纯化文库中富集度较高的候选序列进行化学合成与体外功能验证，成功获得多个对TfR1具有纳摩尔级亲和力的结合肽。
http://doi.org/10.1073/pnas.2524999123
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