据《自然》杂志23日发表的论文,美国杰克逊实验室、麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所以及耶鲁大学的团队利用人工智能(AI)技术设计出数千个新的DNA开关。这些新设计的元件能够精准控制基因在不同类型细胞中的表达,为人类健康与医学研究提供了前所未有的可能性。
尽管近年来,基因编辑和其他基因治疗手段已让科学家能够在活细胞中修改基因,但要在不干扰整个生物体的情况下,只对某一类型的细胞进行基因干预,依然存在挑战。这主要是因为对于控制基因开启和关闭的DNA开关——顺式调节元件(CRE)的理解还不够深入。此次创新的核心在于,新方法可以针对特定的细胞类型来提高或降低基因表达,却不会影响到身体其他部分。
团队采用了深度学习算法,基于数十万个人类基因组中的DNA序列训练了一个模型。通过这个模型,他们可在实验室环境中测量3种细胞(血液、肝脏和大脑)中CRE的活性。该AI模型可预测任意序列的活性,从而揭示了DNA中新的模式以及CRE序列的语法是如何影响RNA生成量的。
基于上述发现,团队构建了名为CODA(计算优化DNA活性)的平台。通过结合实验数据和计算建模的迭代过程,该平台不断改进其预测CRE生物学效应的能力,成功设计出了自然界中未曾出现过的CRE。
经过测试,新设计的合成CRE表现出了比天然存在的CRE更优异的细胞类型特异性。它们不仅包含了促进目标细胞类型中基因表达的序列,还含有抑制非目标细胞类型中基因表达的元素。目前,团队已在斑马鱼和小鼠身上验证了几种合成CRE序列的有效性。
这一突破性进展意味着,未来可能实现更加精确和个性化的基因疗法,为预防和治疗疾病开辟了新途径。
总编辑圈点:
在生物体内,并不是所有基因都会在合适的细胞和合适的时间点发挥作用。CRE的功能,就在于确保适当的基因在正确的时间、正确的地点被激活。譬如,避免皮肤细胞使用了大脑所需的基因,或是防止成人体内激活仅在早期发育阶段需要的基因。此次团队不仅合成了全新的CRE,还展示了如何使用这些CRE选择性地激活大脑、肝脏或血液细胞中的基因,同时确保这些基因在其他类型的细胞中保持沉默。这在生物医学和技术上具有双重重要意义。
据《自然》杂志23日发表的论文,美国杰克逊实验室、麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所以及耶鲁大学的团队利用人工智能(AI)技术设计出数千个新的DNA开关。这些新设计的元件能够精准控制基因在不同类型细胞中的表达,为人类健康与医学研究提供了前所未有的可能性。
尽管近年来,基因编辑和其他基因治疗手段已让科学家能够在活细胞中修改基因,但要在不干扰整个生物体的情况下,只对某一类型的细胞进行基因干预,依然存在挑战。这主要是因为对于控制基因开启和关闭的DNA开关——顺式调节元件(CRE)的理解还不够深入。此次创新的核心在于,新方法可以针对特定的细胞类型来提高或降低基因表达,却不会影响到身体其他部分。
团队采用了深度学习算法,基于数十万个人类基因组中的DNA序列训练了一个模型。通过这个模型,他们可在实验室环境中测量3种细胞(血液、肝脏和大脑)中CRE的活性。该AI模型可预测任意序列的活性,从而揭示了DNA中新的模式以及CRE序列的语法是如何影响RNA生成量的。
基于上述发现,团队构建了名为CODA(计算优化DNA活性)的平台。通过结合实验数据和计算建模的迭代过程,该平台不断改进其预测CRE生物学效应的能力,成功设计出了自然界中未曾出现过的CRE。
经过测试,新设计的合成CRE表现出了比天然存在的CRE更优异的细胞类型特异性。它们不仅包含了促进目标细胞类型中基因表达的序列,还含有抑制非目标细胞类型中基因表达的元素。目前,团队已在斑马鱼和小鼠身上验证了几种合成CRE序列的有效性。
这一突破性进展意味着,未来可能实现更加精确和个性化的基因疗法,为预防和治疗疾病开辟了新途径。
总编辑圈点:
在生物体内,并不是所有基因都会在合适的细胞和合适的时间点发挥作用。CRE的功能,就在于确保适当的基因在正确的时间、正确的地点被激活。譬如,避免皮肤细胞使用了大脑所需的基因,或是防止成人体内激活仅在早期发育阶段需要的基因。此次团队不仅合成了全新的CRE,还展示了如何使用这些CRE选择性地激活大脑、肝脏或血液细胞中的基因,同时确保这些基因在其他类型的细胞中保持沉默。这在生物医学和技术上具有双重重要意义。
记者从中国科学院金属研究所获悉,该所沈阳材料科学国家研究中心胡卫进研究员与合作者,提出利用缓冲层定量调控薄膜应变,延迟铁电薄膜晶格弛豫从而增强铁电极化强度的策略,成功揭示极化强度同铁电 马斯克开源3140亿参数的Grok,大模型争相开源所为何求? 作者:刘晓洁 特斯拉CEO埃隆・马斯克(Elon Musk)给大模型领域投下一枚重磅炸弹。 北京时间3月18日凌晨,马斯克旗下大模型公司 xAI 在官网宣布开源 3140 据英国《自然》杂志网站19日报道,美国华盛顿大学科学家首次使用生成式人工智能(AI)工具,帮助他们制造全新抗体。研究团队表示,AI设计抗体或能更好靶向一些很难被攻击的药物标靶,但这些抗体距离临床 3月18日,记者从中南大学生殖与干细胞研究所获悉,研究所林戈、卢光琇教授团队提出的一项新理论称,原始生殖细胞的性染色体组成在人类性别决定中起关键作用。相关论文日前发表于国际生殖领域杂志 美国加州理工学院喷气推进实验室的一个机器人专家团队,与卡内基梅隆大学机器人研究所科学家合作,开发出一种蛇形机器人,用于调查土星第六大卫星土卫二的地形,以寻找生命的“蛛丝马迹”。相关研究 3月24日消息,今日一则#男孩捡17岁女生电话归还反被讹200#的话题登上微博热搜,引发网民热议。据报道,3月23日,山西长治。郭女士父亲捡到一台iPhone电话,归还时机主反称电话后壳里的200元现金不见了。郭 。本文链接:人工智能设计出数千个新DNA开关,可精准控制基因表达http://www.sushuapos.com/show-2-9034-0.html
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