记者27日从中国农业科学院获悉,该院农业基因组研究所农业基因编辑技术研发与应用创新团队构建了全球规模最大的实验验证数据集,并基于此开发出人工智能(AI)大模型AlphaCD。该模型不仅能高效预测超过2万余种胞嘧啶脱氨酶的酶活特征,还能设计出新型高性能碱基编辑工具。相关成果日前发表于国际期刊《细胞研究》。
胞嘧啶碱基编辑器是一种基因编辑工具,广泛应用于疾病治疗、动植物育种等研究领域。“但传统胞嘧啶碱基编辑器研发依赖大量试错实验,成本高、周期长,且难以系统优化酶活特征。”论文通讯作者、中国农业科学院农业基因组研究所研究员左二伟说。
为破解这一难题,研究团队历时3年,实验测试了1100种胞嘧啶脱氨酶变体的催化效率、脱靶效应等核心指标,首次建立了覆盖多维功能特征的大规模实验数据库。
基于该数据库,团队整合蛋白质序列、三维结构、理化性质等多模态数据,开发出AlphaCD。经严格验证,AlphaCD在预测胞嘧啶脱氨酶催化效率、脱靶活性、靶向窗口及基序偏好等关键指标时,准确性显著优于传统方法。
“AlphaCD突破了当前AI大模型依赖超算资源的局限。”左二伟介绍,研究团队采用随机森林算法发现,在个人计算机上即可完成模型训练。这一轻量化设计能让学术机构低成本开展高通量功能预测。
记者27日从中国农业科学院获悉,该院农业基因组研究所农业基因编辑技术研发与应用创新团队构建了全球规模最大的实验验证数据集,并基于此开发出人工智能(AI)大模型AlphaCD。该模型不仅能高效预测超过2万余种胞嘧啶脱氨酶的酶活特征,还能设计出新型高性能碱基编辑工具。相关成果日前发表于国际期刊《细胞研究》。
胞嘧啶碱基编辑器是一种基因编辑工具,广泛应用于疾病治疗、动植物育种等研究领域。“但传统胞嘧啶碱基编辑器研发依赖大量试错实验,成本高、周期长,且难以系统优化酶活特征。”论文通讯作者、中国农业科学院农业基因组研究所研究员左二伟说。
为破解这一难题,研究团队历时3年,实验测试了1100种胞嘧啶脱氨酶变体的催化效率、脱靶效应等核心指标,首次建立了覆盖多维功能特征的大规模实验数据库。
基于该数据库,团队整合蛋白质序列、三维结构、理化性质等多模态数据,开发出AlphaCD。经严格验证,AlphaCD在预测胞嘧啶脱氨酶催化效率、脱靶活性、靶向窗口及基序偏好等关键指标时,准确性显著优于传统方法。
“AlphaCD突破了当前AI大模型依赖超算资源的局限。”左二伟介绍,研究团队采用随机森林算法发现,在个人计算机上即可完成模型训练。这一轻量化设计能让学术机构低成本开展高通量功能预测。
竹类植物是竹亚科植物的总称,与水稻、小麦、大麦和燕麦同属于禾本科BOP分支,具有重要的经济、生态和文化价值。为更好地服务竹类植物的系统进化和功能研究,有效整理归纳盘活海量的竹类组学和分 记者日前获悉,位于四川成都未来科技城应用性科创区的民航科技创新示范区(B区)航站楼项目,近日取得施工许可证。这也意味着全国首个模拟验证机场开工。该民航科技创新示范区相关负责人表示,预计模 3月21日是世界睡眠日,今年中国主题为“健康睡眠 人人共享”。人的一生约有三分之一的时间是在睡眠中度过,睡眠、运动、营养被视为保障机体正常发育和健康的三大要素。关于睡眠有哪些常见认知误 近日,美国纽约州立大学石溪分校科学家菲格罗阿等人在一篇发表于《自然·量子信息》上的论文中称,他们通过把两个独立的光子存储在铷气里,首次在室温条件下构建了一个量子存储器网络。鉴于 3月24日,据央视财经消息,在今天开幕的中国发展高层论坛2024年年会现场,苹果公司首席执行官蒂姆·库克回应记者提问表示,苹果公司的Apple Vision Pro头显产品将在今年年内于中国市场上市, 3月21日,人工智能大模型赋能企业科技创新研讨会在广州召开。中国知网在会议期间发布了专利大数据智能应用产品“AI Pat+”。据中国知网相关负责人介绍,中国知网在人工智能大模型领域的深入研发 。本文链接:设计基因编辑工具的AI大模型问世http://www.sushuapos.com/show-2-13599-0.html
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