试想你在体验一款模拟细胞培养的游戏,可以借助游戏中的“百科全书”“3D建模器”“实时监测系统”3个核心模块和一间“自动实验室”培养和优化各种虚拟细胞。这样的设计架构,能否应用于现实的科研工作?
3月25日,西湖大学医学院特聘研究员郭天南团队在国际期刊《细胞研究》发表评述文章,系统阐述了人工智能(AI)虚拟细胞的构建方法与发展方向。该团队提出“3+1”方案,即整合先验知识、静态结构和动态状态三大核心数据与闭环主动学习系统,构建了精确且可扩展的AI虚拟细胞模型,将加速生物医学研究与药物开发进程。
传统的细胞实验通常需要消耗大量资源,且实验结果易受细胞变异影响。因此,科学家提出虚拟细胞的概念,以减少实验成本并提高研究的准确性和效率。早期的虚拟细胞模型依赖低通量的生化实验,并使用微分方程或随机模拟方法对特定的细胞过程建模。这一模型数据整合和动态模拟能力有限,难以全面描述细胞的复杂性。随着高通量生物技术和人工智能的发展,AI虚拟细胞成为一种新的研究方向。
郭天南团队提出,AI虚拟细胞的构建,依赖三大数据支柱:先验知识包括生物医学文献、分子表达及成像数据,为模型提供基础框架;静态结构基于冷冻电镜、空间组学等技术构建,能提供细胞的三维空间结构信息;动态状态涵盖生理过程及外部微扰带来的影响,科研人员可依托高通量组学数据,系统分析大量分子在不同细胞状态下的变化,确保AI虚拟细胞的“活性”。
“三大数据支柱分别像模拟细胞游戏中的‘百科全书’‘3D建模’和‘实时监测系统’,再结合AI算法,可为虚拟细胞的构建提供必要基础。”郭天南介绍,传统构建方法依赖被动数据积累,团队提出的闭环主动学习系统,能自动识别知识缺口、设计实验、自动化执行扰动,并实时优化模型,其核心优势在于高效处理细胞对不同扰动的复杂响应。
为确保AI虚拟细胞概念的可行性,团队选择以酵母作为初始研究对象。“因为酵母结构简单又包含真核细胞结构,数据相对丰富,并已在生物学和药物筛选领域得到广泛应用。”郭天南说,降低门槛,从简单模型入手,有助于优化AI虚拟细胞的数据需求、建模策略和评估框架,为未来将研究扩展到更复杂细胞系统奠定基础。
该团队认为,AI虚拟细胞依赖AI驱动的多模态数据整合,并结合深度学习技术来解析复杂数据,其有利于推动系统生物学、个性化医学和药物研发等领域的发展,为细胞行为研究提供新视角。
试想你在体验一款模拟细胞培养的游戏,可以借助游戏中的“百科全书”“3D建模器”“实时监测系统”3个核心模块和一间“自动实验室”培养和优化各种虚拟细胞。这样的设计架构,能否应用于现实的科研工作?
3月25日,西湖大学医学院特聘研究员郭天南团队在国际期刊《细胞研究》发表评述文章,系统阐述了人工智能(AI)虚拟细胞的构建方法与发展方向。该团队提出“3+1”方案,即整合先验知识、静态结构和动态状态三大核心数据与闭环主动学习系统,构建了精确且可扩展的AI虚拟细胞模型,将加速生物医学研究与药物开发进程。
传统的细胞实验通常需要消耗大量资源,且实验结果易受细胞变异影响。因此,科学家提出虚拟细胞的概念,以减少实验成本并提高研究的准确性和效率。早期的虚拟细胞模型依赖低通量的生化实验,并使用微分方程或随机模拟方法对特定的细胞过程建模。这一模型数据整合和动态模拟能力有限,难以全面描述细胞的复杂性。随着高通量生物技术和人工智能的发展,AI虚拟细胞成为一种新的研究方向。
郭天南团队提出,AI虚拟细胞的构建,依赖三大数据支柱:先验知识包括生物医学文献、分子表达及成像数据,为模型提供基础框架;静态结构基于冷冻电镜、空间组学等技术构建,能提供细胞的三维空间结构信息;动态状态涵盖生理过程及外部微扰带来的影响,科研人员可依托高通量组学数据,系统分析大量分子在不同细胞状态下的变化,确保AI虚拟细胞的“活性”。
“三大数据支柱分别像模拟细胞游戏中的‘百科全书’‘3D建模’和‘实时监测系统’,再结合AI算法,可为虚拟细胞的构建提供必要基础。”郭天南介绍,传统构建方法依赖被动数据积累,团队提出的闭环主动学习系统,能自动识别知识缺口、设计实验、自动化执行扰动,并实时优化模型,其核心优势在于高效处理细胞对不同扰动的复杂响应。
为确保AI虚拟细胞概念的可行性,团队选择以酵母作为初始研究对象。“因为酵母结构简单又包含真核细胞结构,数据相对丰富,并已在生物学和药物筛选领域得到广泛应用。”郭天南说,降低门槛,从简单模型入手,有助于优化AI虚拟细胞的数据需求、建模策略和评估框架,为未来将研究扩展到更复杂细胞系统奠定基础。
该团队认为,AI虚拟细胞依赖AI驱动的多模态数据整合,并结合深度学习技术来解析复杂数据,其有利于推动系统生物学、个性化医学和药物研发等领域的发展,为细胞行为研究提供新视角。
据阿根廷布宜诺斯艾利斯经济新闻网2月19日报道,在人工智能(AI)迅速重新定义就业格局的今天,通常被称为“软”技能的人类技能成为最有韧性、最有价值的技能。这是阿尼什·拉曼和玛丽亚&mi 记者3月20日从西安交通大学第二附属医院获悉,该院皮肤病院夏育民教授科研团队研究设计了一种靶向抗双链抗体的D型模拟肽(D-ALW多肽)纳米微粒,成功应用于MRL/lpr红斑狼疮小鼠模型的治疗,为目前红斑 3月21日记者从中国科学技术大学获悉,该校物理学院张斗国教授课题组,提出并实现了一种基于矢量光场调控原理的动量空间偏振滤波器件。科研人员将该滤波器件安装于传统无标记光学显微镜的出射端, 人类的语言自产生以来,就不断演化发展。发音、词汇、语法的演变过程,是语言学家较为关注的领域。语言演化的根本动力是什么,演化又呈现出怎样的规律?我国科学家主导的一项心理学研究显示,人类的某 中国气象局下一代大气数值模式日前发布。该模式采用完全自主的动力框架算法——多矩约束有限体积方法为基础算法,进一步提升全球公里级和区域百米级尺度数值预报的精度,显著减小全球 3月23日消息,据最新爆料,vivo X100s Pro已经获得3C认证,估计 会在5月份前后发布。该机可以看做是vivo X100 Pro的小迭代机型,属于半代升级款,与去年X90s类似。新机从此前的天玑9300升级为天玑9300+,处 。本文链接:“3+1”方案把细胞实验搬到AI虚拟世界http://www.sushuapos.com/show-2-11768-0.html
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