试想你在体验一款模拟细胞培养的游戏,可以借助游戏中的“百科全书”“3D建模器”“实时监测系统”3个核心模块和一间“自动实验室”培养和优化各种虚拟细胞。这样的设计架构,能否应用于现实的科研工作?
3月25日,西湖大学医学院特聘研究员郭天南团队在国际期刊《细胞研究》发表评述文章,系统阐述了人工智能(AI)虚拟细胞的构建方法与发展方向。该团队提出“3+1”方案,即整合先验知识、静态结构和动态状态三大核心数据与闭环主动学习系统,构建了精确且可扩展的AI虚拟细胞模型,将加速生物医学研究与药物开发进程。
传统的细胞实验通常需要消耗大量资源,且实验结果易受细胞变异影响。因此,科学家提出虚拟细胞的概念,以减少实验成本并提高研究的准确性和效率。早期的虚拟细胞模型依赖低通量的生化实验,并使用微分方程或随机模拟方法对特定的细胞过程建模。这一模型数据整合和动态模拟能力有限,难以全面描述细胞的复杂性。随着高通量生物技术和人工智能的发展,AI虚拟细胞成为一种新的研究方向。
郭天南团队提出,AI虚拟细胞的构建,依赖三大数据支柱:先验知识包括生物医学文献、分子表达及成像数据,为模型提供基础框架;静态结构基于冷冻电镜、空间组学等技术构建,能提供细胞的三维空间结构信息;动态状态涵盖生理过程及外部微扰带来的影响,科研人员可依托高通量组学数据,系统分析大量分子在不同细胞状态下的变化,确保AI虚拟细胞的“活性”。
“三大数据支柱分别像模拟细胞游戏中的‘百科全书’‘3D建模’和‘实时监测系统’,再结合AI算法,可为虚拟细胞的构建提供必要基础。”郭天南介绍,传统构建方法依赖被动数据积累,团队提出的闭环主动学习系统,能自动识别知识缺口、设计实验、自动化执行扰动,并实时优化模型,其核心优势在于高效处理细胞对不同扰动的复杂响应。
为确保AI虚拟细胞概念的可行性,团队选择以酵母作为初始研究对象。“因为酵母结构简单又包含真核细胞结构,数据相对丰富,并已在生物学和药物筛选领域得到广泛应用。”郭天南说,降低门槛,从简单模型入手,有助于优化AI虚拟细胞的数据需求、建模策略和评估框架,为未来将研究扩展到更复杂细胞系统奠定基础。
该团队认为,AI虚拟细胞依赖AI驱动的多模态数据整合,并结合深度学习技术来解析复杂数据,其有利于推动系统生物学、个性化医学和药物研发等领域的发展,为细胞行为研究提供新视角。
试想你在体验一款模拟细胞培养的游戏,可以借助游戏中的“百科全书”“3D建模器”“实时监测系统”3个核心模块和一间“自动实验室”培养和优化各种虚拟细胞。这样的设计架构,能否应用于现实的科研工作?
3月25日,西湖大学医学院特聘研究员郭天南团队在国际期刊《细胞研究》发表评述文章,系统阐述了人工智能(AI)虚拟细胞的构建方法与发展方向。该团队提出“3+1”方案,即整合先验知识、静态结构和动态状态三大核心数据与闭环主动学习系统,构建了精确且可扩展的AI虚拟细胞模型,将加速生物医学研究与药物开发进程。
传统的细胞实验通常需要消耗大量资源,且实验结果易受细胞变异影响。因此,科学家提出虚拟细胞的概念,以减少实验成本并提高研究的准确性和效率。早期的虚拟细胞模型依赖低通量的生化实验,并使用微分方程或随机模拟方法对特定的细胞过程建模。这一模型数据整合和动态模拟能力有限,难以全面描述细胞的复杂性。随着高通量生物技术和人工智能的发展,AI虚拟细胞成为一种新的研究方向。
郭天南团队提出,AI虚拟细胞的构建,依赖三大数据支柱:先验知识包括生物医学文献、分子表达及成像数据,为模型提供基础框架;静态结构基于冷冻电镜、空间组学等技术构建,能提供细胞的三维空间结构信息;动态状态涵盖生理过程及外部微扰带来的影响,科研人员可依托高通量组学数据,系统分析大量分子在不同细胞状态下的变化,确保AI虚拟细胞的“活性”。
“三大数据支柱分别像模拟细胞游戏中的‘百科全书’‘3D建模’和‘实时监测系统’,再结合AI算法,可为虚拟细胞的构建提供必要基础。”郭天南介绍,传统构建方法依赖被动数据积累,团队提出的闭环主动学习系统,能自动识别知识缺口、设计实验、自动化执行扰动,并实时优化模型,其核心优势在于高效处理细胞对不同扰动的复杂响应。
为确保AI虚拟细胞概念的可行性,团队选择以酵母作为初始研究对象。“因为酵母结构简单又包含真核细胞结构,数据相对丰富,并已在生物学和药物筛选领域得到广泛应用。”郭天南说,降低门槛,从简单模型入手,有助于优化AI虚拟细胞的数据需求、建模策略和评估框架,为未来将研究扩展到更复杂细胞系统奠定基础。
该团队认为,AI虚拟细胞依赖AI驱动的多模态数据整合,并结合深度学习技术来解析复杂数据,其有利于推动系统生物学、个性化医学和药物研发等领域的发展,为细胞行为研究提供新视角。
据英国《金融时报》网站3月13日报道,科学家们已经在利用人工智能(AI)阐释人体所谓的“黑暗基因组”,并开发一种可能很强大的癌症检测、监测和治疗新方法。美国约翰斯·霍普金斯大学的研 记者3月20日从中国科学院地质与地球物理研究所获悉,该所科研人员在东北黑土区开展了大范围的野外调查和样品采集工作,通过分析采集的黑土样品发现,黑土物质最初都是由风力搬运而来。相关研究成 春,推也。从草从日,草春时生也。进入春日,人们时常能在大地回暖、万物复苏中见证旺盛的生命力。一起解锁空间站里的“春日关键词”,感受太空中的“春日力量”吧!春日关键词:温暖空间站内 四季如春 那些在吃完一顿饱饭后不久就在冰箱里翻找零食的人,可能不是胃口好,而是因为寻找食物的神经元过度活跃的缘故。美国加州大学洛杉矶分校心理学家在老鼠大脑中发现了一个回路:即使它们不饿,也会让它 21世纪经济报道记者 石恩泽 深圳报道操作系统似乎对地理入迷。鸿蒙和深圳,就像Windows和西雅图,也似Linux和赫尔辛基。这是地理与技术的紧密交融。深圳,可以说是鸿蒙的诞生之地,在全球科 3月25日6时左右将迎来水星东大距。这是水星今年第二次大距、首次东大距,也是公众尝试观测水星的好机会。届时,水星位于太阳东边,与太阳张角约为18.7度。以北京地区为例,在日落时,水星地平高度约为 。本文链接:“3+1”方案把细胞实验搬到AI虚拟世界http://www.sushuapos.com/show-2-11768-0.html
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