科技日报北京5月8日电 (记者张梦然)《自然》8日报道了结构生物学最新进展——阿尔法折叠3的问世。它能以高准确率预测蛋白质与其他生物分子相互作用的结构。这种用计算机解析蛋白质与其他分子复杂相互作用的能力,将拓展人们对生物过程的理解,并有望推动药物研发。
阿尔法折叠于2020年问世,它和迭代版阿尔法折叠2能根据蛋白质的氨基酸序列预测其3D结构。之后的阿尔法折叠—多聚体则推动了对蛋白质—蛋白质复合物的预测。不过,扩大单一深度学习模型能预测的复合物范围一直很难,因为不同类型的特异性相互作用差异太大。
此次最新模型由谷歌深度思维以及同是谷歌旗下的人工智能药物公司Isomorphic Labs研发。由于阿尔法折叠2模型的深度学习架构和训练系统得到大幅提升,研发团队如今可以对一个统一框架内大量生物分子系统的结构进行更准确预测。阿尔法折叠3能预测蛋白质与其他蛋白质、核酸、小分子、离子、修饰蛋白质残基的复合物,以及抗体—抗原相互作用。预测准确性显著超过当前预测工具,包括阿尔法折叠—多聚体。
研发团队认识到这一新方法还存在一些局限性,比如约4.4%的结构会出现不正确的手性(一种对称特性),或是幻觉导致“飘带”(一种常见的蛋白质二级结构元素)的出现减少。他们补充道,准确率进一步提升需要生成一个很大的预测集并对预测结构进行排序,而这会产生额外的计算成本。
一种使用深度学习方法设计出来的新蛋白质。图片来源:华盛顿大学医学院蛋白质设计研究所 美国科学家借助机器学习 近日,“面向经济主战场 共建科技创新生态”科技创新驱动高质量发展研讨会在京举行。中国科学院相关科研院所数十位专家出 中新网伦敦1月2日电 (彭欣怡)当地1月2日,英国气象局发布数据指出,2023年是英国自1884年有气象记录以来第二热的一年,仅 近日,日本新潟大学等机构参与的一个国际研究团队报告,他们利用载人潜水器调查了日本海沟,在海底发现了2011年日本“ 2日,世界华人数学家联盟2023年会在复旦大学开幕。这是世界华人数学家联盟年会首次在上海举行。当天,上海数学与交叉学 关于公布2023年辽宁省自然科学学术成果奖评选结果的通知 各市人力资源和社会保障局,省级学会(协会、研究会),市科学技术协 。本文链接:“阿尔法折叠3”来了http://www.sushuapos.com/show-11-5921-0.html
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