一个雄心勃勃的多机构倡议,俗称“扫描所有脊椎动物”计划,已准备就绪。3月6日,研究人员在《生物科学》杂志上宣布,该计划已完成了创建一个免费的在线自然历史标本库的工作,这些标本均来自美国各地的博物馆和大学的收藏。该计划简称oVert,由美国佛罗里达自然历史博物馆的生物学家指导,由美国国家科学基金会提供250万美元资助,涵盖了所有两栖动物、爬行动物、鱼类和哺乳动物的一半以上属。
oVert计划收藏的标本。
在2017年至2023年间,18个合作机构的研究人员使用CT扫描对超过1.3万个脊椎动物标本进行了3D重建。虽然大多数模型都是骨骼,但有些模型也用临时增强对比度的溶液进行了染色,使研究人员能够看到皮肤、肌肉和其他软组织。当扫描特别大或笨重的标本时,比如美国爱达荷自然历史博物馆的座头鲸,oVert项目成员必须找到创造性的解决办法,于是就有了这段迷人的视频:一只加拉帕戈斯象龟倒立在充气游泳管上。
由此产生的数字动物园有点像16世纪流行的“好奇柜”,里面经常有不寻常的动物标本。但是,这些数据通常是隐藏起来的,只供少数富人享用,而公开的数据对科学家、学生、教师和任何能上网的人都是免费的。
oVert团队报告称,截至2023年12月,该数据库的浏览量超过100万次,下载量近10万次。收集的数据已经产生了一些有趣的科学发现,包括非洲多刺老鼠的不寻常骨骼,以及青蛙在其进化史上失去和重新获得牙齿超过20次的证据。项目组织者还培训中学教师将这些图像用于科学教育。
展望未来,oVert团队计划继续对博物馆标本进行成像,并向公众开放。佛罗里达自然历史博物馆的博士后Jaimi Gray目前正在进行一个名为“非临床断层扫描用户研究网络”的项目,旨在与科学、工业和教育领域的广泛用户网络共享oVert数据。
“我们并没有点燃标本3D成像的最初火焰。”项目负责人、佛罗里达自然历史博物馆爬虫学馆长David Blackburn说,“但我们帮助培育和发展了它,使它得到了传播并点燃了许多博物馆和科学家。”
相关论文信息:https://doi.org/10.1093/biosci/biad120
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