科技日报北京6月30日电 （记者张佳欣）美国弗吉尼亚理工大学科学家团队开发出一种名为“RNAbpFlow”的AI模型，在RNA结构预测任务中的表现可媲美谷歌旗下“深度思维”公司开发的“阿尔法折叠3”，且无需依赖海量进化序列数据库，有望加速RNA靶向药物研发。相关研究发表于新一期《自然·方法》杂志。
RNA是mRNA疫苗等生物技术的核心分子，但其三维结构复杂且不断变化，比蛋白质更难预测。长期以来，由于RNA相关结构数据稀缺，科学家难以准确描绘其空间构象，这也成为RNA药物研发的一大瓶颈。
研究团队介绍，在一项国际通用基准的盲测中，RNAbpFlow成功预测了14个RNA目标中的12个正确结构，而“阿尔法折叠3”只预测了8个。更重要的是，RNAbpFlow无需依赖大多数主流工具所需的大规模进化序列数据库，仅利用RNA序列及碱基配对信息即可完成预测。
与“阿尔法折叠”等主要依靠进化信息推断结构的方法不同，RNAbpFlow采用近年来生成式AI领域广泛应用的流匹配技术，通过端到端方式直接生成RNA的全原子三维结构。模型从完全随机的噪声出发，在碱基配对信息引导下逐步折叠形成正确构象，并可一次生成多个不同结构，从而更好地反映RNA分子的动态变化。
该方法最大的优势在于对数据依赖较低。当前多数AI预测模型需要大量不同物种的相关RNA序列作为训练依据，而这类数据往往十分有限。RNAbpFlow无需这些数据库，因此特别适用于缺乏已知近缘序列的RNA分子。团队已利用该方法预测了新冠病毒基因组中的一个保守RNA结构元件以及实验室构建核酶等分子的结构。
不过，对于尺寸更大、结构更加复杂的RNA，依赖丰富进化信息的现有预测平台仍具有一定优势。RNAbpFlow则在数据稀缺的复杂场景中表现更为突出。
研究团队目前正开发升级版本，并计划参加今年夏季举行的CASP国际结构预测竞赛。
科技日报北京12月18日电 （记者张佳欣）美国威斯康星大学麦迪逊分校工程师使用超音速冷喷涂技术，生产出一种新的核聚变“ 习近平总书记强调，要加大应用基础研究力度，以推动重大科技项目为抓手，打通“最后一公里”，拆除阻碍产业化的“篱笆墙”，疏通 12月19日，湖北省医工交叉创新大会暨首届医疗器械科技成果展示交易会上，湖北金融赋能医工交叉创新发展计划发布。据悉，截至 教育、科技、人才三者相互促进、相辅相成。如何构建符合人才成长规律的教育评价机制，让更多优秀的科技人才脱颖而出？如何 中新网伦敦1月2日电 (彭欣怡)当地1月2日，英国气象局发布数据指出，2023年是英国自1884年有气象记录以来第二热的一年，仅 关于发布2023年度江西省社会科技奖备案目录的通知 各有关单位： 社会力量设奖是我省科学技术奖励工作的组成部分。为杜绝 。本文链接：AI模型以更少数据精准预测RNA三维结构http://www.sushuapos.com/show-11-35954-0.html
声明：本网站为非营利性网站，本网页内容由互联网博主自发贡献，不代表本站观点，本站不承担任何法律责任。天上不会到馅饼，请大家谨防诈骗！若有侵权等问题请及时与本网联系，我们将在第一时间删除处理。
上一篇： 太阳能反应器在户外将废塑料转化为燃料
下一篇： 机器学习筛选出两种新型超导材料