大豆是人类与家畜植物性蛋白质和油的重要来源。目前，利用分子设计育种策略加速大豆育种颇为重要，而揭示关键基因和大豆器官发育的调控网络则对分子设计育种至关重要。
中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜研究团队与合作者，开创性地构建了宏观-单细胞-空间三级转录解析体系。研究基于314份全器官样本的Bulk RNA-seq大数据，锁定器官发育阶段和关键器官的特征基因；继而运用snRNA-seq捕获根、根瘤、茎尖、叶、茎五大功能器官的细胞级表达图谱；最终通过Stereo-seq呈现基因表达的3D空间位置信息，实现大豆器官的3D基因表达可视化。
该研究整合了不同类型转录组数据，完整呈现了大豆基因表达的时空动态信息，为探讨大豆发育提供了新视角。研究鉴定出大豆各器官特异性表达的基因，并以根瘤特异基因为例，证实GmPMTs通过基因串联重复扩张，调控根瘤发育；构建器官发育全景图谱，以叶片发育为例，发现展开期叶片的转录特异性，并挖掘关键的长链脂肪酸共表达模块，为大豆叶片改良提供新线索；构建根尖空间3D转录图谱，揭示大豆根尖细胞分化的动态路径，为豆科根尖发育提供发育蓝图；通过根瘤空间3D单细胞图谱解析根瘤器官的细胞异质性，揭示根瘤共生基因的空间定位，为根系-微生物互作研究建立细胞级时空坐标系。同时，研究发现，维管束特异性GmHBs基因在根瘤早期发育中的决定性作用，为提升大豆共生固氮效率提供了新靶点。
该研究相关的转录组数据库SoyOmics Transcriptome Atlas（https://ngdc.cncb.ac.cn/soyomics/index）和SOTA（https://db.cngb.org/stomics/soybean/）已上线并开放访问，可以提供基因表达查询、比较、空间定位可视化等模块。用户可通过交互式界面检索目标基因在发育阶段、特定器官和细胞类型中的表达特征，以提升功能基因研究效率。
这一研究构建的“时空图谱”揭示了大豆生长发育过程中基因表达的动态轨迹，为解析大豆器官形成机制、挖掘关键发育调控基因提供了技术支撑。
2月18日，相关研究成果以A large-scale integrated transcriptomic atlas for soybean organ development为题，发表在《分子植物》（Molecular Plant）上。研究工作得到国家自然科学基金和国家重点研发计划等的支持。该工作由遗传发育所、崖州湾国家实验室、中国科学院北京基因组研究所等单位合作完成。
论文链接
大豆器官发育的转录组图谱
大豆根尖的3D空间单细胞图谱
大豆根瘤的3D空间单细胞图谱
“未来，创新驱动至关重要，要结合基础与应用研究，利用前沿科技推动产业升级。”11月8日，中国工程院院士、大连工业大学教授朱 为落实元首共识、深化教育交流合作，11月9日，中意大学校长对话会在北京大学举行。教育部部长怀进鹏出席对话会并致辞。他表示，中方坚持教育开放发展，愿同包括意大利在内的世界各国扩大学术交流和教育合作规模，积极参与 本报北京11月5日讯（记者 林焕新）受国务院委托，今天，教育部党组书记、部长怀进鹏向全国人大常委会报告建设中国特色、世界一流的大学和优势学科（以下简称“双一流”建设）工作情况。报告指出，教育部、财政部、国家发展改革 当地时间11月1日，教育部副部长陈杰在巴西福塔莱萨出席二十国集团（G20）教育部长会议和2024年全球教育会议期间，会见英国教育部国务大臣雅基·史密斯。双方就尽快重启中英教育部长级磋商机制达成一致，并同意在此基础上探 教育部关于做好2025届全国普通高校毕业生就业创业工作的通知教就业〔2024〕5号各省、自治区、直辖市教育厅（教委），新疆生产建设兵团教育局，有关省、自治区人力资源社会保障厅，部属各高等学校、部 中国教育报-中国教育新闻网讯（记者 任朝霞）11月11日，以“AI for Science双螺旋引擎驱动科研新范式”为主题的2024科学智能创新论坛在复旦大学枫林校区举行。论坛上，上海科学智能研究院（简称“上智 。本文链接：科学家破解大豆发育“基因密码”助力精准分子育种http://www.sushuapos.com/show-12-773-0.html
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