中新网青岛3月11日电(胡耀杰 王禹)记者11日从中国海洋大学获悉，该校海洋生命学院汪岷教授团队基于序列比对和图论方法，开发了病毒分类新工具Viral Taxonomic Assignment Pipeline(VITAP)。该成果近日在国际知名期刊《自然-通讯》(Nature Communications)上发表，为病毒组学和病毒生态学研究提供了重要工具。
病毒不仅对人类健康产生深远的影响，也是全球生物地球化学循环的幕后推手。目前大多数病毒分类方法主要依赖于接近完整的病毒基因组数据，对片段化和不完整的病毒序列分类效果较差。此外，目前的技术手段大多对双链DNA病毒的分类效果较好，而对RNA病毒和单链DNA病毒的高通量准确分类仍存在困难。特别是对于高度不完整的病毒片段，如何将其准确地进行分类仍然是一个亟须解决的问题。
上述问题限制了业界对环境中复杂病毒群体的深入解析。如何准确细致地对环境病毒进行分类，已成为当今生物学、医学与生态学研究亟待突破的重要挑战。
该研究团队开发的VITAP通过结合序列比对与图论算法，不仅能对DNA及RNA病毒进行精准分类，还为每个分类单元提供了置信度评估，可对长度短至1000个碱基对的病毒基因组序列进行从门到属水平的高效分类，并大幅提升了病毒注释率。
此外，VITAP能够基于国际病毒分类委员会(ICTV)制定的最新分类数据库进行自动更新，并支持用户自定义分类数据库。
在后续的分析测试中，该研究团队将VITAP方法成功应用于宏病毒组和病毒基因组的注释，结果显示VITAP在科级和属级的分类分析中不仅能保持超过90%的准确率、精度和召回率，还显示出了优于其他方法的注释率。
整体而言，VITAP在保证高准确率的前提下，实现了更全面、稳定的病毒分类，并为病毒基因组学、分类学和生态学研究提供了一个高效的自动化新工具。(完)
近日，全国教育信创与密码行业产教融合共同体成立大会及新疆职业院校产教融合人才培养论坛于在乌鲁木齐举办。 航天 国际脑科学计划-细胞普查联盟（BICCN）近日发表了迄今为止最全面详细的小鼠完整大脑细胞类型的特性描述和分类，对大脑的结构 教育、科技、人才三者相互促进、相辅相成。建设人才强国是实现建设教育强国和科技强国战略目标的关键条件。那么，一个重 中新网伦敦1月2日电 (彭欣怡)当地1月2日，英国气象局发布数据指出，2023年是英国自1884年有气象记录以来第二热的一年，仅 科技日报讯 （记者张梦然）美国罗切斯特大学研究人员报告了一种策略，用于了解在具有完全化学复杂性的溶剂中，分子如何失去 关于发布“2023年度华夏建设科学技术奖”授奖项目的公示 华夏奖字〔2023〕第4号 各有关单位： 2023年度华夏建设科学技术 。本文链接：科研人员开发病毒分类新工具，大幅提升病毒注释率http://www.sushuapos.com/show-11-18418-0.html
声明：本网站为非营利性网站，本网页内容由互联网博主自发贡献，不代表本站观点，本站不承担任何法律责任。天上不会到馅饼，请大家谨防诈骗！若有侵权等问题请及时与本网联系，我们将在第一时间删除处理。
上一篇： 颜宁又添新职