美国麻省理工学院化学家们利用生成式人工智能(AI)技术,开发出一种可快速预测三维基因组结构的新模型。新模型能在几分钟内预测出数千种结构,速度远超现有的实验分析方法。研究成果发表于最新一期《科学进展》杂志。
人体每个细胞都含有相同的遗传序列,但每个细胞只表达其中一部分基因。这种细胞特异性的基因表达模式确保了不同类型细胞之间的差异,而这些表达模式部分取决于遗传物质的三维结构。
新模型名为ChromoGen,旨在从底层DNA序列出发,预测三维基因组结构。它包括两个组成部分,第一部分是一个深度学习模型,能够“读取”基因组,分析编码在DNA序列和染色质可访问性数据中的信息;第二部分是一个生成式AI模型,经过训练后能够预测出物理上准确的染色质构象。
训练该模型所用的数据集包括超过1100万个染色质构象,这些数据来源于对16个人类B淋巴细胞系单细胞进行的实验。
ChromoGen模型能有效地捕捉序列—结构关系,为每段DNA序列生成多种可能的结构。这是因为DNA是一种非常无序的分子,同一个DNA序列可以产生许多不同的构象。这种方法不仅大大加速了三维基因组结构的预测过程,也为深入研究基因组的三维组织如何影响细胞的基因表达模式和功能提供了有力工具。
这一突破性技术有望帮助科学家更快地理解基因调控机制,促进疾病治疗和生物技术领域的进步。
美国麻省理工学院化学家们利用生成式人工智能(AI)技术,开发出一种可快速预测三维基因组结构的新模型。新模型能在几分钟内预测出数千种结构,速度远超现有的实验分析方法。研究成果发表于最新一期《科学进展》杂志。
人体每个细胞都含有相同的遗传序列,但每个细胞只表达其中一部分基因。这种细胞特异性的基因表达模式确保了不同类型细胞之间的差异,而这些表达模式部分取决于遗传物质的三维结构。
新模型名为ChromoGen,旨在从底层DNA序列出发,预测三维基因组结构。它包括两个组成部分,第一部分是一个深度学习模型,能够“读取”基因组,分析编码在DNA序列和染色质可访问性数据中的信息;第二部分是一个生成式AI模型,经过训练后能够预测出物理上准确的染色质构象。
训练该模型所用的数据集包括超过1100万个染色质构象,这些数据来源于对16个人类B淋巴细胞系单细胞进行的实验。
ChromoGen模型能有效地捕捉序列—结构关系,为每段DNA序列生成多种可能的结构。这是因为DNA是一种非常无序的分子,同一个DNA序列可以产生许多不同的构象。这种方法不仅大大加速了三维基因组结构的预测过程,也为深入研究基因组的三维组织如何影响细胞的基因表达模式和功能提供了有力工具。
这一突破性技术有望帮助科学家更快地理解基因调控机制,促进疾病治疗和生物技术领域的进步。
3月18日,伴随着搬运车的轰鸣声,全国首个大规模清洁能源特高压直流输电工程的送端±800千伏特高压祁连换流站迎来了一位“新成员”——1号调相机转子,该换流站第7次年度检修工作 记者从近日举办的新疆筹建融合算力中心研讨会上获悉,新疆将构建具备国家级算力水平的涵盖超算、智算的融合算力中心。到2024年底,建成超算算力(FP64)不低于200P Flops、智算算力(FP16)不低于400P F 3月18日,记者从中南大学生殖与干细胞研究所获悉,研究所林戈、卢光琇教授团队提出的一项新理论称,原始生殖细胞的性染色体组成在人类性别决定中起关键作用。相关论文日前发表于国际生殖领域杂志 近日,美国纽约州立大学石溪分校科学家菲格罗阿等人在一篇发表于《自然·量子信息》上的论文中称,他们通过把两个独立的光子存储在铷气里,首次在室温条件下构建了一个量子存储器网络。鉴于 3月22日消息,美国司法部对iPhone提起诉讼,声称其苹果生态系统构成垄断。司法部表示,iPhone将苹果生态系统视为一种垄断,以牺牲消费者、开发者和竞争对手的利益为代价,推动公司估值的飙升。司法部还指 “啪嗒啪嗒......”一只机器狗在街上迈着规律的步伐,拉着牵引绳的盲人,在它的带领下越过沿路障碍,平稳地行走着,电子导盲犬能否取代传统导盲犬,解决视障人士一犬难求的困境?西工大团队在这方面开展 。本文链接:生成式AI快速预测三维基因组结构http://www.sushuapos.com/show-2-10565-0.html
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