西班牙基因组调控研究中心的科学家们在最新一期《自然·通讯》上发表了一项创新研究,展示了如何利用蛋白质三维形状,解开生命中古老的“历史密码”,揭示了生命之树中最古老的进化关系。这项研究首次将蛋白质的形状数据与基因序列数据结合,提高了进化树的准确性。
进化树对于理解生物间的亲缘关系、病原体传播路径、疫苗研发及新发疾病治疗非常重要。传统上,科学家通过比较DNA或蛋白质的线性序列来构建进化树,但这种方法在处理非常古老的物种时,遇到了“饱和问题”。这是因为随着时间推移,基因组序列变化很大,以至于原始的遗传信息几乎消失。这就如同古老文本因时间久远而字迹模糊,难以辨认。
为了解决这个问题,团队开始关注蛋白质的物理结构。因为这些结构比序列更稳定,能够更长时间保留祖先的特征。即使氨基酸序列发生变化,只要保持了相同的三维折叠模式,蛋白质就能继续发挥相同的功能。
此次团队使用了一种名为“互距离分布”(IMD)的方法,测量了蛋白质内部氨基酸之间的距离,以此来评估结构的变化程度。他们发现,基于这种结构信息构建的进化树,可以避免传统方法遇到的饱和问题,并且能提供更加可靠的进化关系图谱。
当把蛋白质结构和序列信息结合起来时,就像让两位目击者从不同角度描述同一事件,这样可以获得更为完整、准确的结果。例如,在人类基因组中的激酶家族,它们参与了许多细胞活动,也是癌症治疗的重要靶点,通过这种方法可以更好地理解这些激酶之间的进化关系。
该技术的应用潜力十分巨大,不仅有助于人们改进癌症治疗方法,还可以加深对疾病演变的理解,从而促进医疗进步。
(原标题:蛋白质数据+基因序列精准构建进化树 有助疫苗和新发病疗法研究)
根据近日发表于《科学-机器人》的一项研究,人们可以学习用眼睛和胸部肌肉控制第三条手臂。研究人员称,这种“额外肢体”可 ·生产中的模型由“安全系统”团队管理。开发中的前沿模型有“准备”团队,该团队会在模型发布之前识别和量化风险 关于拟备案科学家工作室名单的公示 各有关单位: 根据《黑龙江省中国科学院科学家工作室管理办法(试行)》有关规定, 按照三秦英才引进计划和三秦英才特殊支持计划《实施办法》和2023年省级人才计划评审工作安排,经申报推荐、形式审查 中新社北京1月1日电 (记者 阮煜琳)中国自然资源部海啸预警中心消息,日本本州西岸近海海域1月1日发生7.4级地震已引发 2023年12月28日,陕西省审计厅在官网发布《2023年第9号审计结果公告》,其中西北大学2019年度预算执行及财务收支情况审计 。本文链接:蛋白质数据+基因序列精准构建进化树http://www.sushuapos.com/show-11-16470-0.html
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